阜宁卫生职业技术学院狠抓内涵建设，稳步提高教学质量。现有医学、工学两个学科，临床医学、口腔医学、中医学、预防医学等14个专业，其中，临床医学、药学是中央财政支持的专业服务项目，临床医学、护理是中央财政支持的职业教育实训基地，康复治疗技术（老年康复）是全国职业院校养老服务类示范专业。

       现有26项省级教学质量工程项目，5个综合改革试点专业，3个省级教学团队，5个省级示范性实训基地。学校临床医学专业教学资源库入选国家教学资源库备选项目，建有1个国家级医师资格考试实践技能考试基地（临床医学）。中华医学会、中国高等教育学会共计公布11次全国高职高专医学院校医学教育论文排名，学校10次排名第一。